Związany z autofagią gen 16 like 1 (ATG16L1) wariant genetyczny Thr300Ala wiąże się ze zwiększonym ryzykiem rozwoju choroby Leśniowskiego-Crohna. Może on jednak wplywac na patogenezę choroby poprzez interakcję z odpornością gospodarza, fenotypem choroby i podatnością na infekcje drobnoustrojami, które mogą wywolywac patologię choroby. Niniejsze badanie dostarcza dowodów na znaczenie wariantu genetycznego ATG16L1 T300A na stan immunologiczny gospodarza, fenotyp kliniczny i prezentację, a także ryzyko nabycia drobnoustrojów (Norovirus i / lub H. pylori) w próbkach tkanek u pacjentów z chorobą Leśniowskiego-Crohna (CD) w porównaniu z wrzodziejącym zapaleniem jelita grubego (UC) jako grupą kontrolną i zdrową grupą kontrolną (HC). Interakcja między allelem ryzyka ATG16L1 T300A związanym z obniżeniem peptydów przeciwdrobnoustrojowych, akumulacją autofagosomów zawierających drobnoustroje, agresywną odpowiedzią zapalną IL-17A i tendencją do ciężkich objawów klinicznych.